MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia fergusonii ATCC 35469 plasmid pEFER

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011743	GAG	2	6	88	93	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011743	CAG	2	6	125	130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011743	CGC	2	6	135	140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011743	T	6	6	283	288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011743	TTCTTT	2	12	290	301	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011743	ATA	2	6	379	384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011743	CAA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011743	CAA	2	6	441	446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011743	TCC	2	6	1332	1337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011743	C	6	6	1336	1341	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_011743	TTG	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011743	G	6	6	1362	1367	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011743	GTC	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011743	GTC	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011743	TGC	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011743	TAG	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011743	T	7	7	2188	2194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011743	A	6	6	2227	2232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011743	G	6	6	7333	7338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011743	ACCA	2	8	8171	8178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011743	CAC	2	6	8182	8187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011743	TAC	2	6	8281	8286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011743	CAG	2	6	8327	8332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011743	AGTAT	2	10	8412	8421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011743	TGA	2	6	8422	8427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011743	AAT	2	6	8449	8454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011743	CA	3	6	8487	8492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011743	CA	3	6	8540	8545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011743	GC	3	6	8700	8705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011743	CA	3	6	8910	8915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011743	CA	3	6	8947	8952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011743	GC	3	6	8996	9001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011743	TGA	2	6	9354	9359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011743	CAG	2	6	9376	9381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011743	GCC	2	6	9388	9393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011743	CGT	2	6	9422	9427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011743	CTT	2	6	9474	9479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011743	CAGGG	2	10	9507	9516	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011743	ACA	2	6	9577	9582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011743	TTG	2	6	9592	9597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011743	CAA	2	6	10635	10640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011743	GAG	2	6	10676	10681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011743	ACT	2	6	11038	11043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011743	AGT	2	6	11060	11065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011743	ACA	2	6	11067	11072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011743	CAT	2	6	11075	11080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011743	ACT	2	6	11091	11096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011743	GCG	3	9	11115	11123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011743	GTG	2	6	11131	11136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011743	ATG	2	6	11174	11179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011743	TTC	2	6	11211	11216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011743	GACGCG	2	12	11262	11273	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011743	ATA	2	6	29669	29674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011743	GCC	2	6	32733	32738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011743	TTA	2	6	33699	33704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011743	CT	4	8	33718	33725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011743	TCC	2	6	33790	33795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011743	CGT	2	6	33809	33814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011743	AGC	2	6	33843	33848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011743	AGA	2	6	33889	33894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011743	GTT	2	6	33965	33970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011743	TCA	2	6	34003	34008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011743	AGCGCA	2	12	34049	34060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011743	ACC	3	9	34234	34242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011743	AC	3	6	34255	34260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011743	TGC	2	6	34320	34325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011743	ATA	2	6	38132	38137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011743	AAT	2	6	38262	38267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011743	AT	3	6	39166	39171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011743	GATT	2	8	39178	39185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011743	TTTAA	2	10	39198	39207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011743	ATAG	2	8	40963	40970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011743	TCT	2	6	40989	40994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011743	A	6	6	41002	41007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011743	CAT	2	6	41053	41058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011743	CAA	2	6	42339	42344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011743	TTA	2	6	44367	44372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011743	CAA	2	6	44375	44380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011743	TGC	2	6	44439	44444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011743	TGT	2	6	44452	44457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011743	CTT	2	6	44466	44471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011743	TAT	2	6	44523	44528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011743	T	6	6	44535	44540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011743	T	6	6	44542	44547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011743	CAT	2	6	44595	44600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011743	TTG	2	6	44610	44615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011743	TAA	2	6	44695	44700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011743	AC	3	6	46010	46015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011743	TAT	2	6	46042	46047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011743	AATT	2	8	46120	46127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011743	ATT	2	6	46173	46178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011743	AAAT	2	8	46208	46215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011743	GA	3	6	46359	46364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011743	TGT	2	6	47581	47586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011743	ATT	2	6	47590	47595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011743	CTTAA	2	10	47642	47651	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011743	TCA	2	6	47679	47684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011743	A	6	6	47718	47723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011743	GA	3	6	47736	47741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011743	TCA	2	6	47838	47843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011743	TG	3	6	50218	50223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011743	TTCTG	2	10	50988	50997	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011743	CTG	2	6	51018	51023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011743	TGT	2	6	51029	51034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011743	TA	3	6	51059	51064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011743	AATAG	2	10	51105	51114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011743	CTC	2	6	51183	51188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011743	GGA	2	6	51284	51289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011743	TGATC	2	10	51294	51303	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011743	CAA	2	6	51332	51337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011743	TGTC	2	8	51348	51355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011743	ATT	2	6	51371	51376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011743	GGTA	2	8	52124	52131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011743	A	6	6	52217	52222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011743	GC	3	6	52253	52258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011743	AT	3	6	52308	52313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011743	CCCCT	2	10	52320	52329	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
118	NC_011743	CAC	2	6	52348	52353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011743	TAATT	2	10	52449	52458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011743	GTT	2	6	52461	52466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011743	GCT	2	6	52472	52477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011743	TAT	2	6	52478	52483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011743	GAT	2	6	52546	52551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011743	ATG	2	6	54530	54535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011743	TTG	2	6	55002	55007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011743	ATT	2	6	55064	55069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011743	GT	3	6	55078	55083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011743	ACG	2	6	55130	55135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.